Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms