Protein–RNA interactions for Protein: Q15513

SPHAR, Protein SPHAR, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHARQ15513 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPHARQ15513 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPHARQ15513 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms