Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 POLG-203ENST00000526314 700 ntTSL 316.71■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TNFRSF1B-203ENST00000492361 3583 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-210ENST00000484318 971 ntTSL 516.43■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 516.35■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 516.24■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 516.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 516.05■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 216.04■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 216.02■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 416.02■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-203ENST00000562015 563 ntTSL 415.87■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 215.84■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-204ENST00000526398 512 ntTSL 315.84■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 LIPE-AS1-202ENST00000593491 292 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RASA3-202ENST00000542651 975 ntTSL 515.66■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-208ENST00000461200 3325 ntTSL 215.56■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS33B-205ENST00000556096 1731 ntTSL 215.46■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 415.37■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-212ENST00000484523 582 ntTSL 515.35■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-226ENST00000479442 511 ntTSL 215.33■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PLXNA1-202ENST00000503234 4446 ntTSL 215.28■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-222ENST00000494153 757 ntTSL 515.2■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS33B-208ENST00000574755 2356 ntTSL 215.07■□□□□ 04e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-203ENST00000344042 847 ntTSL 515□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-205ENST00000460225 443 ntTSL 514.97□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-206ENST00000460389 1075 ntTSL 514.97□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 214.95□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 214.94□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS33B-206ENST00000557358 561 ntTSL 414.91□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 WDR1-216ENST00000514319 719 ntTSL 514.87□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 414.84□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 514.8□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 314.8□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.077e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 314.6□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SDCCAG3-210ENST00000481114 340 ntTSL 214.59□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-215ENST00000635986 2351 ntTSL 514.59□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MYO19-204ENST00000610992 5743 ntTSL 214.57□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 214.57□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-206ENST00000424568 731 ntTSL 214.56□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 314.56□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-204ENST00000465445 2554 ntTSL 514.5□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SAPCD1-211ENST00000494299 574 ntTSL 314.49□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-213ENST00000631044 4668 ntTSL 514.46□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 514.27□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-211ENST00000532584 708 ntTSL 314.22□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-218ENST00000555510 584 ntTSL 514.15□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 414.02□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 214□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ESYT1-210ENST00000551790 540 ntTSL 414□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 LIPE-AS1-207ENST00000597203 556 ntTSL 413.98□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 513.92□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-203ENST00000460049 2672 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 313.71□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-216ENST00000554982 716 ntTSL 413.7□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-207ENST00000464173 587 ntTSL 213.7□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 513.68□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 413.65□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 WDR1-211ENST00000508079 812 ntTSL 313.54□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ATF6B-216ENST00000494022 320 ntTSL 213.54□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SDCCAG3-205ENST00000417512 626 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 413.49□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 30.6
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 160.3 ms