Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms