Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms