Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRHP20396 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRHP20396 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRHP20396 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRHP20396 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRHP20396 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRHP20396 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRHP20396 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRHP20396 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRHP20396 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRHP20396 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRHP20396 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRHP20396 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRHP20396 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRHP20396 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRHP20396 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRHP20396 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRHP20396 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRHP20396 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
TRHP20396 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRHP20396 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRHP20396 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRHP20396 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRHP20396 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRHP20396 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRHP20396 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRHP20396 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRHP20396 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms