Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF2P15336 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF2P15336 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF2P15336 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF2P15336 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF2P15336 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF2P15336 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF2P15336 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF2P15336 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF2P15336 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF2P15336 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF2P15336 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF2P15336 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATF2P15336 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATF2P15336 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATF2P15336 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF2P15336 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms