Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC192P0DO97 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC192P0DO97 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms