Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM17P0DL12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM17P0DL12 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms