Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A1P05023 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A1P05023 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms