Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB3O75712 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB3O75712 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB3O75712 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB3O75712 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB3O75712 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB3O75712 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB3O75712 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB3O75712 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB3O75712 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB3O75712 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB3O75712 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB3O75712 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB3O75712 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB3O75712 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB3O75712 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB3O75712 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB3O75712 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB3O75712 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms