Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 IL17RC-211ENST00000440502 772 ntTSL 319.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-218ENST00000628630 556 ntTSL 419.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-219ENST00000628651 563 ntTSL 419.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.692e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IGHMBP2-202ENST00000536803 444 ntTSL 319.33■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TUSC2-203ENST00000421918 790 ntTSL 519.24■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-249ENST00000640024 2848 ntTSL 519.23■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-221ENST00000583961 581 ntTSL 519.23■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PELI2-203ENST00000561019 558 ntTSL 519.21■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SERPINH1-207ENST00000526397 882 ntTSL 519.19■□□□□ 0.662e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NME1-210ENST00000512768 1056 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.665e-8■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-247ENST00000639945 2434 ntTSL 519.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATPAF2-202ENST00000462733 1737 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FERMT3-203ENST00000540554 379 ntTSL 319.09■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCARB2-203ENST00000502908 2552 ntTSL 219.08■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNF138-209ENST00000585103 608 ntTSL 419.05■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HSPG2-204ENST00000412328 828 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNASEH2C-206ENST00000533698 710 ntTSL 318.99■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCRN2-209ENST00000582459 1624 ntTSL 518.95■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-216ENST00000582327 561 ntTSL 418.95■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PIMREG-208ENST00000573557 831 ntTSL 318.95■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-212ENST00000580716 567 ntTSL 418.95■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CABIN1-207ENST00000459824 532 ntTSL 218.91■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PFAS-203ENST00000578979 765 ntTSL 218.9■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TBRG4-208ENST00000478116 641 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LPAR2-205ENST00000588461 609 ntTSL 418.85■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MST1R-212ENST00000497001 1488 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-217ENST00000638288 2995 ntTSL 518.83■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C17orf49-206ENST00000549857 2343 ntTSL 218.83■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-251ENST00000640295 2410 ntTSL 518.83■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-226ENST00000490512 1059 ntTSL 218.82■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-222ENST00000476810 1044 ntTSL 518.82■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-212ENST00000451165 1053 ntTSL 218.82■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-211ENST00000565881 1565 ntTSL 518.8■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-219ENST00000638484 2622 ntTSL 518.72■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-216ENST00000568273 1711 ntTSL 218.7■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FERMT3-208ENST00000545896 911 ntTSL 518.7■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KRI1-215ENST00000618579 516 ntTSL 318.67■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-225ENST00000638678 2064 ntTSL 518.65■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-215ENST00000568210 1717 ntTSL 218.65■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNASEH2C-207ENST00000534482 913 ntTSL 318.65■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-208ENST00000434756 946 ntTSL 518.58■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-219ENST00000466046 2547 ntTSL 218.52■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FKBP8-204ENST00000596015 612 ntTSL 318.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PARG-204ENST00000610922 1487 ntTSL 218.41■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.36■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BAP1-204ENST00000469613 1654 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AC024592.3-203ENST00000585661 431 ntAPPRIS P1 TSL 218.3■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-213ENST00000565279 912 ntTSL 518.3■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-213ENST00000580723 594 ntTSL 418.27■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HMG20A-210ENST00000560498 631 ntTSL 418.26■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-205ENST00000561955 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 418.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 UEVLD-207ENST00000535340 724 ntTSL 218.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CRACR2A-206ENST00000535507 2511 ntTSL 218.24■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TOLLIP-211ENST00000530541 684 ntTSL 218.22■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-207ENST00000424206 949 ntTSL 318.2■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TDH-204ENST00000534302 1421 ntTSL 218.19■□□□□ 0.52e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCYL1-212ENST00000531601 896 ntTSL 318.16■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AC024592.3-201ENST00000592091 2118 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CEP83-204ENST00000546527 644 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 172.3
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 289.9 ms