Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 WDR43-201ENST00000296126 787 ntTSL 52.33□□□□□ -2.043e-7■■■■■ 29
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RBFOX2O43251 MELTF-AS1-205ENST00000446695 204 ntTSL 37.2□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 29
RBFOX2O43251 MELTF-AS1-203ENST00000424769 356 ntTSL 26.54□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 29
RBFOX2O43251 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 29
RBFOX2O43251 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 317.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 29
RBFOX2O43251 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 29
RBFOX2O43251 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 414.34□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 29
RBFOX2O43251 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 29
RBFOX2O43251 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 29
RBFOX2O43251 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 29
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RBFOX2O43251 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 214.5□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 28.9
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RBFOX2O43251 SMPD4P1-202ENST00000433066 483 ntTSL 35.35□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 DVL1-205ENST00000631679 778 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 45.26□□□□□ -1.572e-8■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 TMEM135-203ENST00000525018 753 ntTSL 57.11□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.513e-8■■■■■ 28.9
RBFOX2O43251 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 518.36■□□□□ 0.532e-26■■■■■ 28.9
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RBFOX2O43251 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.157e-16■■■■■ 28.8
RBFOX2O43251 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 28.8
RBFOX2O43251 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 28.8
RBFOX2O43251 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 28.8
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RBFOX2O43251 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 28.8
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RBFOX2O43251 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 28.8
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RBFOX2O43251 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 28.8
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RBFOX2O43251 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 28.8
RBFOX2O43251 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 28.8
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RBFOX2O43251 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 310.33□□□□□ -0.769e-11■■■■■ 28.8
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RBFOX2O43251 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)9.14□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 28.8
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RBFOX2O43251 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 28.7
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RBFOX2O43251 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 58.69□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 28.7
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RBFOX2O43251 CD99-206ENST00000449611 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.58□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 28.7
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RBFOX2O43251 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ABLIM2-207ENST00000502800 297 ntTSL 516.56■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 28.7
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RBFOX2O43251 NFE2L1-211ENST00000580050 476 ntTSL 414.46□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-220ENST00000584634 588 ntTSL 414.1□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-217ENST00000583210 512 ntTSL 412.04□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 28.7
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RBFOX2O43251 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 59.74□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-208ENST00000579537 372 ntTSL 49.53□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 CSF1-208ENST00000526001 573 ntTSL 49.46□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 28.7
RBFOX2O43251 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 28.7
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