Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAB1O14561 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms