Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ALDH7A1-224ENST00000636743 2332 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KCNH8-201ENST00000328405 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL512378.1-201ENST00000394808 2100 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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