Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 EPB42-201ENST00000300215 4553 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SPATA3-AS1-201ENST00000414876 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC025279.1-201ENST00000604430 4818 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 OR10G3-202ENST00000641040 2533 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BSND-201ENST00000371265 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GLDN-210ENST00000612989 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TSTD2-201ENST00000341170 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MUC4-203ENST00000346145 3982 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA8-201ENST00000398604 4605 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ATP2C2-202ENST00000416219 3472 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC114811.2-201ENST00000569927 5647 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GPRASP2-205ENST00000543253 3935 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PDE6B-212ENST00000496514 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TNC-201ENST00000341037 6786 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL606970.1-201ENST00000445442 2559 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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