Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01558Q9Y6Z2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01558Q9Y6Z2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms