Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms