Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-203ENST00000535520 1626 ntTSL 25.05□□□□□ -1.66e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC6.77□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 412.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 CCDC138-205ENST00000456512 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 53.76□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 MAN1B1-205ENST00000480100 3483 ntTSL 211.38□□□□□ -0.597e-8■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 515.45■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 214.85□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 314.28□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 23.28□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.644e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -04e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 LINC01748-201ENST00000439156 1798 ntTSL 511.17□□□□□ -0.628e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SSBP3-210ENST00000525990 701 ntTSL 29.25□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SSBP3-215ENST00000533946 431 ntTSL 37.41□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 LINC01748-205ENST00000635616 2143 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.578e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-212ENST00000509333 743 ntTSL 212.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-220ENST00000514830 802 ntTSL 29.99□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-207ENST00000503974 2081 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-223ENST00000627587 1853 ntTSL 28.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM5-214ENST00000510099 554 ntTSL 44.16□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-210ENST00000458113 3490 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-214ENST00000470782 3987 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 27.26□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-212ENST00000464381 2474 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-219ENST00000580554 650 ntTSL 25.7□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 NCOR1-217ENST00000579606 551 ntTSL 42.9□□□□□ -1.954e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-214ENST00000486083 699 ntTSL 510.85□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 47.11□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 RNGTT-204ENST00000627296 2017 ntTSL 213.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 SGMS1-208ENST00000608287 542 ntTSL 416.04■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 27
EXOSC5Q9NQT4 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 215.41■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 522.03■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 218.92■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 518.9■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 25.07□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 ACER3-206ENST00000527508 531 ntTSL 23.16□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.531e-6■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 PRH1-202ENST00000536086 554 ntTSL 54.93□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 26.9
EXOSC5Q9NQT4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-15■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 TBL3-204ENST00000567615 1047 ntTSL 213.09□□□□□ -0.313e-15■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-211ENST00000564177 576 ntTSL 414.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-214ENST00000565372 572 ntTSL 414.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-216ENST00000565970 2388 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-212ENST00000564590 2507 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-215ENST00000565507 2627 ntTSL 511.57□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-219ENST00000568382 544 ntTSL 410.02□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-201ENST00000303521 5438 ntTSL 25.71□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 POLK-216ENST00000514296 1536 ntTSL 510.38□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 POLK-203ENST00000503479 2482 ntTSL 26.88□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 POLK-206ENST00000505774 565 ntTSL 44.59□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 POLK-208ENST00000506928 3820 ntTSL 54.56□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 POLK-213ENST00000510815 2677 ntTSL 24.16□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 26.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP192-214ENST00000589596 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.36□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 26.8
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