Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms