Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM47Q96LD4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms