Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A3Q96HJ5 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms