Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPDL1Q96EA4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms