Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FUBP1Q96AE4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FUBP1Q96AE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FUBP1Q96AE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FUBP1Q96AE4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FUBP1Q96AE4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FUBP1Q96AE4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FUBP1Q96AE4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FUBP1Q96AE4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms