Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNJLQ8IV13 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJLQ8IV13 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms