Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF550Q7Z398 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF550Q7Z398 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms