Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGO2Q562F6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO2Q562F6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms