Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACKR1Q16570 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACKR1Q16570 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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