Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 54.16□□□□□ -1.742e-44■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 TUFM-204ENST00000569217 814 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 SPTLC2-203ENST00000554901 1518 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 TEAD3-203ENST00000433586 657 ntTSL 58.95□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 ALDOA-214ENST00000564688 613 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-13■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-207ENST00000619482 561 ntTSL 216.81■□□□□ 0.285e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-202ENST00000612728 1981 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.255e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-206ENST00000619446 819 ntTSL 39.65□□□□□ -0.865e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-204ENST00000617429 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.095e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-210ENST00000620863 881 ntTSL 28.25□□□□□ -1.095e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-209ENST00000620324 834 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.125e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-212ENST00000622312 567 ntTSL 46.73□□□□□ -1.335e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-203ENST00000616269 616 ntTSL 36.65□□□□□ -1.345e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 MARK2-213ENST00000540169 558 ntTSL 46.39□□□□□ -1.396e-9■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.415e-11■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 MARK2-214ENST00000543220 595 ntTSL 45.14□□□□□ -1.596e-9■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 REEP4-206ENST00000521744 635 ntTSL 317.16■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 U2AF1-206ENST00000464750 966 ntTSL 1 (best)24.3■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 U2AF1-211ENST00000486519 682 ntTSL 313.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 U2AF1-209ENST00000475639 4694 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 U2AF1-212ENST00000496462 3973 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 46.8
EFTUD2Q15029 VARS-223ENST00000474643 885 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 46.7
EFTUD2Q15029 MGAT4B-206ENST00000518867 732 ntTSL 58.58□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 46.7
EFTUD2Q15029 RNH1-213ENST00000528713 1202 ntTSL 1 (best)17.68■□□□□ 0.423e-10■■■■■ 46.7
EFTUD2Q15029 RNH1-221ENST00000532055 704 ntTSL 37.84□□□□□ -1.153e-10■■■■■ 46.7
EFTUD2Q15029 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 AATK-208ENST00000573469 754 ntTSL 516.34■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.38□□□□□ -2.354e-41■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-208ENST00000531357 1484 nt19.48■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-204ENST00000526555 507 ntTSL 513.67□□□□□ -0.223e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 CYP4F12-212ENST00000548501 598 ntTSL 311.8□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 46.6
EFTUD2Q15029 EEF1A1-207ENST00000490569 1802 ntTSL 58.8□□□□□ -13e-20■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 LMNA-225ENST00000515824 393 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-16■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZC3H14-209ENST00000554602 652 ntTSL 522.18■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZC3H14-218ENST00000556158 849 ntTSL 322.13■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZC3H14-207ENST00000553495 577 ntTSL 320.41■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZC3H14-213ENST00000555799 813 ntTSL 318.32■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.947e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.327e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.337e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 MAP7D1-213ENST00000532131 771 ntTSL 524.12■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.454e-7■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 CRIP2-211ENST00000552643 1383 ntTSL 224.12■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 CRIP2-204ENST00000547643 1373 ntTSL 322.22■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 CRIP2-203ENST00000538259 991 ntTSL 217.67■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 CRIP2-208ENST00000550577 817 ntTSL 211.27□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZNF142-202ENST00000432460 813 ntTSL 318.64■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZNF142-206ENST00000450560 373 ntTSL 317.76■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZNF142-207ENST00000450765 6028 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.125e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.395e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 ZNF142-203ENST00000433921 5800 ntTSL 212□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 SMNDC1-203ENST00000460483 753 ntTSL 310.77□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 SMNDC1-204ENST00000471297 823 ntTSL 36.11□□□□□ -1.435e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.545e-8■■■■■ 46.5
EFTUD2Q15029 UBXN6-207ENST00000591919 1613 ntTSL 518.72■□□□□ 0.597e-8■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.477e-8■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 CREB3-202ENST00000486056 1496 ntTSL 217.55■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.818e-8■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 PRR14-201ENST00000287463 2124 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 PRR14-206ENST00000564946 2117 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 46.4
EFTUD2Q15029 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.579e-11■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 TCF12-210ENST00000558908 553 ntTSL 417.45■□□□□ 0.389e-11■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.169e-11■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 213.27□□□□□ -0.289e-11■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.419e-11■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.449e-11■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.159e-11■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 MOB1A-202ENST00000463975 1799 ntTSL 216.77■□□□□ 0.276e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 MOB1A-203ENST00000488006 482 ntTSL 315.01□□□□□ -0.016e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 MOB1A-206ENST00000497054 784 ntTSL 212.97□□□□□ -0.336e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 MOB1A-201ENST00000396049 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 MOB1A-204ENST00000494600 493 ntTSL 29.84□□□□□ -0.836e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 WDR43-203ENST00000434238 386 ntTSL 318.32■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 23.68□□□□□ -1.822e-27■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 TFRC-209ENST00000464368 569 ntTSL 49.04□□□□□ -0.961e-16■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-211ENST00000567717 857 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 415.31■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 46.3
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