Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIDRQ14159 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIDRQ14159 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms