Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TGM3Q08188 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms