Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms