Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms