Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D1P54289 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms