Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms