Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKACGP22612 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKACGP22612 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKACGP22612 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKACGP22612 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKACGP22612 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms