Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PVALBP20472 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PVALBP20472 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PVALBP20472 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PVALBP20472 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PVALBP20472 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PVALBP20472 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms