Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TBPP20226 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TBPP20226 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TBPP20226 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TBPP20226 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TBPP20226 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TBPP20226 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TBPP20226 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TBPP20226 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms