Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD58P19256 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD58P19256 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD58P19256 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD58P19256 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD58P19256 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD58P19256 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD58P19256 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD58P19256 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD58P19256 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD58P19256 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD58P19256 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD58P19256 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD58P19256 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD58P19256 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD58P19256 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD58P19256 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD58P19256 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD58P19256 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD58P19256 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD58P19256 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD58P19256 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD58P19256 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD58P19256 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD58P19256 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD58P19256 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD58P19256 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD58P19256 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD58P19256 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms