Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRR35P0CG20 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRR35P0CG20 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRR35P0CG20 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRR35P0CG20 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRR35P0CG20 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRR35P0CG20 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR35P0CG20 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRR35P0CG20 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRR35P0CG20 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms