Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MITFO75030 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MITFO75030 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MITFO75030 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MITFO75030 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MITFO75030 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MITFO75030 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MITFO75030 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MITFO75030 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MITFO75030 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MITFO75030 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MITFO75030 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MITFO75030 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MITFO75030 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MITFO75030 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms