Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS4Q9NRS4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4Q9NRS4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms