Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC177Q9NQR7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms