Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC32Q9BV29 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC32Q9BV29 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms