Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms