Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE1Q96RT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE1Q96RT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms