Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms