Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms