Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.6 ms