Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACS2Q86VP3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms